एक ऐतिहासिक दो महीने के परीक्षण के अंत में, अमेरिकी सीनेट तीन महीने पहले प्रतिनिधि सभा द्वारा राष्ट्रपति के खिलाफ महाभियोग के आरोपों को स्वीकार करने में विफल रहता है। सीनेटरों ने महाभियोग के दूसरे लेख पर 35 दोषियों को दोषी ठहराया और 19 को दोषी नहीं ठहराया, पिछले वर्ष उनके कार्यकाल के कार्यालय अधिनियम के उल्लंघन से संबंधित एक आरोप। दस दिन पहले, सीनेट इसी तरह जॉनसन को महाभियोग के दूसरे लेख पर दोषी ठहराने में विफल रही, 11 वीं, एक समान 35 को दोषी ठहराते हुए और 19 को बरी करने के लिए। क्योंकि जॉनसन को दोषी ठहराने के लिए दो-तिहाई बहुमत की आवश्यकता के कारण दोनों वोट कम हो गए, इसलिए उन्हें दोषी ठहराया गया और वे पद पर नहीं रहे।

1861 में गृहयुद्ध के प्रकोप पर, जॉनसन, टेनेसी से अमेरिकी सीनेटर, एक निर्जन राज्य से एकमात्र सीनेटर थे जो संघ के प्रति वफादार रहे। जॉनसन का राजनीतिक कैरियर भूमिहीन वर्गों के खिलाफ गरीब सफेद Southerners के हितों की रक्षा पर बनाया गया था; धर्मनिरपेक्षता का विरोध करने के अपने निर्णय पर, उन्होंने कहा, '' नीग्रोओं को धिक्कार है; मैं उन गद्दार कुलीनों, उनके आकाओं से लड़ रहा हूं। ”अपनी वफादारी के लिए, राष्ट्रपति अब्राहम लिंकन ने उन्हें 1862 में टेनेसी का सैन्य गवर्नर नियुक्त किया, और 1864 में जॉनसन को संयुक्त राज्य का उपाध्यक्ष चुना गया।

अप्रैल 1865 में लिंकन की हत्या के बाद राष्ट्रपति के रूप में शपथ ली, राष्ट्रपति जॉनसन ने पराजित दक्षिण के लिए एक उदार पुनर्निर्माण नीति बनाई, जिसमें पूर्व-कन्फेडरेट्स के लिए लगभग कुल माफी, एकांत राज्यों के लिए अमेरिकी-राज्य की स्थिति की तेजी से बहाली का कार्यक्रम, और अनुमोदन शामिल है। नई, स्थानीय दक्षिणी सरकारें, जो "ब्लैक कोड" को कानूनन करने में सक्षम थीं, जो सभी लेकिन नाम में गुलामी की प्रणाली को संरक्षित करती थीं। रिपब्लिकन बहुल कांग्रेस ने जॉनसन के पुनर्निर्माण कार्यक्रम का बहुत विरोध किया और राष्ट्रपति की वीटो को बार-बार ओवरराइड करके "रेडिकल रिकंस्ट्रक्शन" पारित किया।कट्टरपंथी पुनर्निर्माण के तहत, स्थानीय दक्षिणी सरकारों ने संघीय सैन्य शासन का मार्ग प्रशस्त किया और दक्षिण में अफ्रीकी अमेरिकी पुरुषों को मतदान का संवैधानिक अधिकार दिया गया।

मार्च 1867 में, जॉनसन के अधिकार को और कमजोर करने के लिए, कांग्रेस ने अपने वीटो के ऊपर कार्यकाल का अधिनियम पारित किया। अधिनियम ने राष्ट्रपति को संघीय कार्यालय धारकों को हटाने से रोक दिया, जिसमें कैबिनेट सदस्य शामिल थे, जिन्हें सीनेट द्वारा सहमति के बिना सीनेट द्वारा पुष्टि की गई थी। इसे युद्ध के एडविन एम। स्टैंटन के सचिव की तरह जॉनसन कैबिनेट के सदस्यों को ढालने के लिए डिज़ाइन किया गया था, जो लिंकन प्रशासन के दौरान नियुक्त किए गए थे और कांग्रेस में तथाकथित रेडिकल रिपब्लिकन के प्रमुख सहयोगी थे। 1867 के पतन में, जॉनसन ने स्टैंटन को जनरल यूलिसिस एस ग्रांट के साथ बदलकर अधिनियम की संवैधानिकता का परीक्षण करने का प्रयास किया। हालांकि, अमेरिकी सुप्रीम कोर्ट ने मामले पर शासन करने से इनकार कर दिया, और सीनेट द्वारा बर्खास्तगी के विरोध में एक उपाय पारित करने के बाद ग्रांट ने स्टैंटन को वापस कार्यालय में बदल दिया।

21 फरवरी, 1868 को, जॉनसन ने एक बार और सभी के लिए स्टैंटन से छुटकारा पाने का फैसला किया और जनरल लोरेंजो थॉमस को युद्ध के सचिव के रूप में ग्रांट की तुलना में कांग्रेस से कम व्यक्तिगत रूप से नियुक्त किया। स्टैंटन ने उपज देने से इनकार कर दिया, अपने कार्यालय में खुद को बैरिकेडिंग और प्रतिनिधि सभा, जो पहले ही जॉनसन द्वारा स्टैंटन को बर्खास्त करने के बाद महाभियोग पर चर्चा की थी, ने राष्ट्रपति के खिलाफ औपचारिक महाभियोग की कार्यवाही शुरू की। 24 फरवरी को, सदन ने राष्ट्रपति जॉनसन के खिलाफ 11 महाभियोग लेखों को वोट दिया। आलेखों में से नौ ने कार्यालय अधिनियम के कार्यकाल के उनके उल्लंघन का हवाला दिया; एक ने 1867 के सेना विनियोग अधिनियम के अपने विरोध का हवाला दिया (अमेरिकी सेना के प्रमुख के रूप में अपने संवैधानिक पद के अध्यक्ष को वंचित करने के लिए डिज़ाइन किया गया); और एक जॉनसन ने कुछ विवादास्पद भाषणों के माध्यम से जॉनसन को "अपमान, उपहास, घृणा, अवमानना ​​और संयुक्त राज्य अमेरिका की कांग्रेस को फटकारने" का आरोप लगाया।

13 मार्च को, अमेरिकी संविधान के अनुच्छेद I की धारा 3 में निर्धारित नियमों के अनुसार, सीनेट में राष्ट्रपति जॉनसन का महाभियोग परीक्षण शुरू हुआ। अमेरिकी सुप्रीम कोर्ट के मुख्य न्यायाधीश सैल्मन पी। चेस ने कार्यवाही की अध्यक्षता की, जिसे नाटकीय बताया गया। 16 मई को और फिर 26 मई को, सीनेट ने राष्ट्रपति जॉनसन के खिलाफ लगाए गए आरोपों पर मतदान किया। महाभियोग के लिए कमजोर मामला क्या था, इसके खिलाफ मतदान में 12 डेमोक्रेट के साथ सात उदारवादी रिपब्लिकन शामिल होने के साथ दोनों बार सजा के लिए वोट 35 और बरी के लिए 19 था। वोट दो-तिहाई बहुमत से कम हो गया और जॉनसन अपने पद पर बने रहे। फिर भी, उन्होंने डेमोक्रेटिक टिकट पर पुनर्मिलन की तलाश नहीं की। नवंबर में, यूलेसिस एस। ग्रांट, जिन्होंने रिपब्लिकन की कट्टरपंथी पुनर्निर्माण नीतियों का समर्थन किया, संयुक्त राज्य अमेरिका के राष्ट्रपति चुने गए।

1875 में, दो असफल बोलियों के बाद, जॉनसन ने टेनेसी से अमेरिकी सीनेटर के रूप में कांग्रेस के लिए पुनर्मिलन जीता। पद ग्रहण करने के चार महीने से भी कम समय के बाद उनकी मृत्यु हो गई। पचास साल बाद, अमेरिकी सर्वोच्च न्यायालय ने अपने फैसले में असंवैधानिक रूप से कार्यालय अधिनियम के कार्यकाल की घोषणा की मायर्स बनाम यूनाइटेड स्टेट्स.